Сюжет фильма основан на малоизвестной за пределами Германии славянской народной легенде о колдуне на мельнице, который берет к себе в ученики осиротевших подростков во время Тридцатилетней войны. 13-летний Крабат, потерявший родителей от чумы и не имеющий ни дома, ни средств к существованию, случайно попадает на старую мельницу в лесу, где хозяин предлагает ему еду, кров и работу.
